揭秘:“一滴香”肉味香精如何模仿肉味
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棕榈酸甲酯则是生物柴油、化妆品和植物杀螨剂的原料,同时也是具有抗结核和抗纤维前景的药物。同时本研究采用了GC-MS方法,鲜白扁豆花共计检测出13种成分,这些挥发性成分为白扁豆花的药理和临床应用提供了理论依据,也为后续的综合利用提供更充分的理论依据。
月桂酸有较强的抗菌活性,其可通过破坏细胞壁,干扰细胞的信号转导,调控相关因子的转录来发挥杀菌作用,且不易使病原菌产生抗药性。声明:本文所用图片、文字来源《河北中医药学报》,版权归原作者所有。肉豆蔻油酸具有潜在的控制体质量,预防二型糖尿病、心血管病、酒精性脂肪肝和抗炎等作用。综上所述,若考虑鲜白扁豆花的长久使用性、有效性、便利性,可采用冻干白扁豆花,也使得白扁豆花更好的应用于临床,提高临床疗效。3.4 提取条件的考察GC法测定白扁豆花中挥发性成分时,考察了超声提取、回流提取和索式提取3种方法,根据GC指纹图谱的检测结果,发现回流提取的挥发性成分涵盖超声提取和索式提取的产物,故上述结果中,仅列出了回流提取的结果。
相关链接:离子,胆固醇,色谱,白扁豆花。采用NIST标准质谱库检索结合文献资料,对挥发性成分进行定性鉴别,根据正反匹配率800,共得到13种成分,成分鉴定结果详见表2。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。
PPI网络包含35个靶点以及121条边(图3A)。根据P0.05对KEGG通路结果进行筛选,共得到17条相关通路,其中包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路 (AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、HIF-1信号通路 (HIF-1 signaling pathway)以及癌症通路 (pathways in cancer)等通路(图4A)。根据得分最高创建核心靶点网络图(图3B)。在细胞组分(cellular component)中,逍遥散对膜筏 (membrane raft)、囊泡(vesicle lumen)以及核包膜 (nuclear envelope)的影响较大(图4B)。
2.3 关键靶点的查找以及关键活性成分的查找把38个共有靶点导入STRING数据库,并设置interaction score0.9,构建PPI网络。GO富集结果表明,在生物过程(biological process)中,逍遥散对脂多糖(response to lipopolysaccharide)、活性氧代谢 (reactive oxygen species metabolic process)以及细胞因子介导的通路 (cytokine-mediated signaling pathway)等的影响较大。
相关链接:成分,谷固醇,大黄素。在分子功能(molecular function)层面上,逍遥散对细胞因子 (cytokine receptor binding)、磷酸酶 (phosphatase binding)以及血红素(heme binding)等的影响较大。根据单味药-活性成分-共同靶点相互作用网络筛选得到的关键靶点搜寻到相应的8个关键活性成分:槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、-谷固醇(MOL000358)、芦荟大黄素(MOL000471)、Glyasperins M(MOL000354)、刺芒柄花素(MOL000392)、金合欢素(MOL001689)和柚皮素(M OL004328)通过检索GeneCard数据库、TTD数据库以及DrugBank数据库一共得到抑郁症靶点1 598个、乳腺增生疾病靶点844个、功能性消化不良靶点222个。
在Windows终端下运行Autodock 软件,依次加载洁净蛋白和能量优化后的化合物(配体),用Autogrid 计算格点能量,采用拉马克遗传算法进行对接运算。各化合物与蛋白之间结合情况用自由能评价方法评价。1.8 分子对接验证将上述得到的关键活性成分与靶点进行分子对接。对接模拟前,将所有配体用PyMOL软件从蛋白受体复合物中去除,此时加上极性氢原子与电荷,准备对接。
并利用Cytoscape 3.7.1软件的MCODE插件对该网络进行聚类分析,寻找核心靶点网络。1.6 关键靶点的查找将共有靶点导入STRING数据库,构建PPI网络,筛选关键靶点。
相关链接:细胞,蛋白,柴胡。网络图中节点(node)代表逍遥散中活性成分和作用靶点,边(edge)表示活性成分和作用靶点的相互作用关系。
1.5 单味药-活性成分-共同靶点网络的构建利用Cytoscape 3.7.1软件分别构建逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的单味药-活性成分-共同靶点可视化网络。2.2 潜在靶点的预测和单味药-活性成分-共同靶点网络的构建通过TCMSP数据库将化学成分所对应的靶点进行搜集,共得到2 538个靶点,其中白芍123个、白术22个、薄荷124个、柴胡342个、甘草1 753个、茯苓30个、当归69个、生姜75个。1.7 通路分析将逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的关键共有靶点导入Metascape数据库,限定物种为人,对逍遥散的直接作用靶标进行KEGG通路富集和GO富集分析。声明:本文所用图片、文字来源《中国中药杂志》,版权归原作者所有。同时,构建逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的单味药-活性成分-共同靶点网络图(图2)。其中逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共有靶点有38个,分别是IL-4、PCNA、ACHE、BAX、BCL2、CASP3、CAT、CCL2、TP53、CDKN1A、CYP3A4、EGFR、HMOX1、INSR、ICAM1、IFNG、IL-1A、IL-1B、IL-10、IL-6、IL-8、MAPK1、MAPK14、MAPK3、NQO1、NOS2、NOS3、SERPINE1、PARP1、EGF、PTGS2、FOS、AKT1、SLC6A4、TGFB1、TNF、VCAM1和VEGFA。
PCA散点图显示,逍遥散活性成分与现有的临床上治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的小分子药物聚集在一起,表明逍遥散中的这些化合物的理化性质与已知药物相似,具有治疗这3种疾病的潜在性能,有发展成为药物的可能。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。
设定阈值P<0.05,并根据P的排序,筛选排名靠前的生物过程或通路。1.4 逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶点查询利用GeneCards数据库、TTD数据库、DrugBank数据库以及CTD数据库,分别获取抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的潜在靶点。
2 结果2.1 逍遥散化学成分的筛选以及活性预测通过TCMSP数据库对逍遥散中8味中药的ADME参数进行检索,并以OB30%和DL0.18为指标,剔除没有靶点的化学成分,筛选得到121个活性成分,其中白芍8个、白术2个、薄荷7个、柴胡11个、甘草84个、茯苓4个、当归2个、生姜3个。将上述数据库查询到的疾病靶点取交集后,再与逍遥散活性成分所对应的靶点取交集,以获取逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共同作用靶点。
对逍遥散活性成分和现有的治疗这3种疾病药物的物理参数(MW、A Log P、BBB和Caco-2)进行PCA分析(图1)。应用PubChem数据库查找活性成分,并下载其mol2格式,准备对接。将整理搜集到的靶点导入Uniprot数据库中,通过输入靶点基因名称列表并限定物种为人,剔除非人源靶点,并将所有的基因校正为其官方名称(office gene symbol),做后续分析。根据网络图节点的拓扑性参数,以度(degree)2倍的中位数为筛选条件,此类数值越大,说明成为逍遥散异病同治的潜在活性成分的可能性就越大。
其中,GO富集包括生物过程(biological process),分子功能(molecular function)和细胞组分(cellular component)设定阈值P<0.05,并根据P的排序,筛选排名靠前的生物过程或通路。
其中,GO富集包括生物过程(biological process),分子功能(molecular function)和细胞组分(cellular component)。其中逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共有靶点有38个,分别是IL-4、PCNA、ACHE、BAX、BCL2、CASP3、CAT、CCL2、TP53、CDKN1A、CYP3A4、EGFR、HMOX1、INSR、ICAM1、IFNG、IL-1A、IL-1B、IL-10、IL-6、IL-8、MAPK1、MAPK14、MAPK3、NQO1、NOS2、NOS3、SERPINE1、PARP1、EGF、PTGS2、FOS、AKT1、SLC6A4、TGFB1、TNF、VCAM1和VEGFA。
对接模拟前,将所有配体用PyMOL软件从蛋白受体复合物中去除,此时加上极性氢原子与电荷,准备对接。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。
声明:本文所用图片、文字来源《中国中药杂志》,版权归原作者所有。在Windows终端下运行Autodock 软件,依次加载洁净蛋白和能量优化后的化合物(配体),用Autogrid 计算格点能量,采用拉马克遗传算法进行对接运算。1.6 关键靶点的查找将共有靶点导入STRING数据库,构建PPI网络,筛选关键靶点。根据网络图节点的拓扑性参数,以度(degree)2倍的中位数为筛选条件,此类数值越大,说明成为逍遥散异病同治的潜在活性成分的可能性就越大。
1.8 分子对接验证将上述得到的关键活性成分与靶点进行分子对接。将整理搜集到的靶点导入Uniprot数据库中,通过输入靶点基因名称列表并限定物种为人,剔除非人源靶点,并将所有的基因校正为其官方名称(office gene symbol),做后续分析。
1.5 单味药-活性成分-共同靶点网络的构建利用Cytoscape 3.7.1软件分别构建逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的单味药-活性成分-共同靶点可视化网络。并利用Cytoscape 3.7.1软件的MCODE插件对该网络进行聚类分析,寻找核心靶点网络。
应用PubChem数据库查找活性成分,并下载其mol2格式,准备对接。1.4 逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶点查询利用GeneCards数据库、TTD数据库、DrugBank数据库以及CTD数据库,分别获取抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的潜在靶点。
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